El Hospital Belga cuenta con el Comité de Farmacia Terapéutica y Fármaco vigilancia para determinar el manejo de los fármacos de acuerdo los diagnósticos médicos, velar por el buen manejo de los medicamentos y el cumplimiento de todas las normativas vigentes referentes al manejo y dispensación de los medicamentos. cuenta con el servicio de Farmacia Hospitalaria cuya función es garantizar y asumir la responsabilidad técnica de adquisición de medicamentos, su correcta conservación, cobertura de las necesidades de los pacientes hospitalizados y custodia de medicamentos precisos incluidos en la Lista Nacional de Medicamentos LINAME.

La farmacia cuenta con la resolución administrativa que otorga el SEDES para su desenvolvimiento y para su atención de Farmacia se cuenta con personal calificado y un sistema de registro sistematizado que permite la dotación de los medicamentos a los pacientes